2025年春、東京タワーVRアトラクションを設営していたスタッフが行方不明になるという事件が起きた。警察が捜査に乗り出すが、現場からはなんの手がかりも得られないまま操作は難航。唯一の手がかりである設営時に起動していたVRゴーグルを起動させたことで事態は一変する。予定されていたVRアトラクションはそこにはなく、仮想空間に広がっていたのは日本で一番有名なお化け屋敷「戦慄迷宮」だった。時を同じくして一人の霊媒師が東京タワーに訪れる。霊媒師は戦慄迷宮の浸食はさらに拡大すると語り、解呪を行うため仮想空間の戦慄迷宮へと向かうが、スタッフと同じく行方不明となる。続く頂上的な事件になすすべもない警察は調査・解決を、超常的な事件を扱う民間機関「（有）怪異対策機構」に依頼をする。「（有）怪異対策機構」は怪異の調査をどうくじの技術ノウハウを持ち、調査人材を広く一般から募集することで知られている。「戦慄迷宮：迷」と名付けられたこの事案の調査、果たしてその先にはなにがあるのだろうか・・・。そして、富士急ハイランドにある戦慄迷宮は本当は一体なんなのか・・・・。迷宮の入口はもう開いている。